Mescid-i Aksâ’nın Kubbetü’s-Sahra avlusunda, yerin altındadır. İzdüşüm olarak Kubbetü’s-Sahra’nın kuzeybatısındaki Muhammed Halilî Kubbesi’nin tam altına denk gelir. Dışarıdan bakıldığında kimsenin tahmin edemeyeceği mekânın kazı tarihi bilinmemekle birlikte Osmanlı döneminde, 1700’lü yıllarda Kudüs valisi Muhammed Bey tarafından yaptırıldığı rivayetler arasındadır.
Geçmişte inziva ve itikâf yeri olarak kullanmıştır. Mağara hakkında Keşfü’z-Zalem an Makāmi’n-Nebiyyi Aleyhi’s-Selâm adlı bir eser de yazılmıştır. Kitabın Mescid-i Aksâ Yazma Eserleri Onarım Merkezi’nde muhafaza edildiği bilgisi vardır.
Mağaranın üzeri altı ahşap panelle kapatılmış, üzerinde Mescid-i Aksâ İmar Komitesi’nin ofisi bulunmaktadır. Halilî Kubbesi’nin yanında ışık alması ve havalanması için bir pencere bulunmaktadır. Mağaraya inmek için havalandırma kapağı açılarak taştan yapılmış on iki basamaklı merdivenlerden inmek gerekiyor. İçerisinde Osmanlı döneminden kalma mermer üzerine işlemeli bir mihrap bulunmaktadır. Günümüzde ihmal edilmiş ecdat yadigârının en kısa sürede aslına uygun restorasyonun yapılarak ziyarete açılması bekleniyor.