Mescid-i Aksa sahasını süsleyen birçok zarif kubbe bulunmaktadır. Bu kubbeler Emevî döneminden başlayıp, sırasıyla Eyyubi, Memluk ve Osmanlı gibi medeniyetler döneminde inşa edilmişlerdir. Namaz kılanlara gölgelik yapması, eğitim meclislerinin kurulması, ibadet için halvete girilmesi veya itikâf gibi farklı amaçlarla inşa edilmiş olan kubbelerin sayısı 15 kadardır. Bu kubbeler aşağıdaki gibidir: